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科研 | 擴增子技術——煙粉虱抗性基因突變頻率檢測新途徑
2021-03-22 來源:北京市農林科學院官網 閱讀量:138 評論:0
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    煙粉虱Bemisia tabaci  (Gennadius)是全球范圍內分布的重要害蟲,對蔬菜生產造成嚴重影響,其抗藥性是田間防治難點之一。害蟲抗藥性的產生是影響田間防治、阻礙糧食和蔬菜生產的重要因素之一,抗性基因突變頻率的檢測可為害蟲治理提供重要的參考。然而,煙粉虱個體微小,體長不足1mm,傳統的單頭測序操作難度高,且往往獲得微量的gDNA,卻需要消耗大量的時間和資源,在科研工作中亟需新的檢測方式。

北京市農林科學院植環所蔬菜害蟲研究室建立了利用擴增子技術檢測微小型昆蟲基因突變頻率的方法,并對煙粉虱種群中鈉離子通道基因的兩個擬除蟲菊酯抗性相關的點突變的頻率進行了檢測,該方法高效可靠,解決了微小型昆蟲基因突變頻率檢測的難題。

擴增子測序最初用于檢測土壤、植株或動物腸道微生物的群落組成,可以此分析微生物與動植物的互作關系。擴增子測序方法基于二代測序(Next-generation Sequencing)技術,具有較高的測序效率,能夠進行大量樣品的集中檢測,將該技術針對性優化以后,能夠成功應用于昆蟲基因突變的檢測。研究人員通過采集田間煙粉虱種群,經過gDNA提取、擴增子合成、文庫建立、二代測序、數據分析等過程,成功獲得了煙粉虱種群鈉離子通道兩突變位點的頻率數據;與此同時,發現了一種新的突變類型,即兩突變位點發生于同一等位基因的單倍型,此前未見報道。該項研究為微小型昆蟲基因突變頻率的檢測提供了高效可靠的方法,有助于害蟲田間防治工作的開展。

該研究發表于昆蟲學專業期刊Pest Management Science(影響因子3.75),中科院分區Q1。論文第一作者為在站博士后魏亦云,團隊成員王然副研究員、渠成博士以及南京農業大學的管放博士參與了部分工作,羅晨研究員為論文的通訊作者。

全文鏈接:https://doi.org/10.1002/ps.6327

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